يقع مركز التفاعل في قلب النظام الضوئي، وهو إنزيم يستخدم الضوء لاختزال الجزيئات (يزود بالإلكترونات). يحيط مركز التفاعل هذا بمعقدات حصاد الضوء التي تعزز من امتصاص الضوء.
يحتوي مركز التفاعل على عدة (> 24 أو> 33) وحدة بروتين، التي توفر سقالة لسلسلة من العوامل المساعدة. يمكن أن تكون العوامل المساعدة أصباغًا (مثل الكلوروفيلوالفيوفيتينوالكاروتينات) أو الكينونات(quinones) أو مجموعات الكبريت-الحديد.[2]
تنتقل الإلكترونات المُثارة ضوئيًا عبر معقد السيتوكروم (Cytochrome b6f complex)إلى النظام الضوئي الأول(I)عبر سلسلة نقل إلكترونية تقع في غشاء الثايلاكويد. يتم استخدام الطاقة هذه (العملية بِكاملها تسمى التناضحالكيميائي)، لنقل الهيدروجين (H +) عبر الغشاء إلى تجويف الثايلاكويد، لتوفير فرق محتمل في الطاقة بين مساحة تجويف الثايلاكويد والستروما (سدى)[5] البلاستيدات الخضراء، الذي يصل إلى قوة البروتون الدافع التي يمكن استخدامها لتوليد ATP. يتم نقل البروتونات بواسطة البلاستوكينون.إذا مرت الإلكترونات مرة واحدة فقط، فإن العملية تسمى الفسفرة الضوئية غير الدورية (non-cyclic).
عندما يصل الإلكترون إلى النظام الضوئي الأول، فإنه يملأ العجز الإلكتروني في الكلوروفيل في مركز التفاعل في النظام الضوئي الأول. يتم اصطناعATP عندما ينقل الأيه تي بي سينثاز البروتونات الموجودة من التجويف إلى الستروما (سدى) عبر الغشاء. قد تستمر الإلكترونات في الانتقال عبر الإلكترون الدوري حول نظام ضوئي أول أو المرور عبر ال ferredoxinx إلى إنزيم NADP+ reductase.
تضاف الإلكترونات وأيونات الهيدروجين إلى NADP + لتشكيل NADPH. يتم نقل عامل الاختزال هذا إلى دورة كالفن لتتفاعل مع حمض 3-فوسفوغليسيريك، إلى جانب ATP لتشكيل فوسفوجليسرالدهيد، المادة الأساسية التي يمكن أن تجعل منها النباتات مجموعة متنوعة من المواد.