جغرافياً، تكون القرية في اليابان واقعة بشكل كامل ضمن محيط المحافظة. وتكون أكبر من مجرد تجمع للسكان وغالباً تكون جزءاً من المقاطعة الريفية والتي تقسم عادة إلى قرى وبلدات.
بنتيجة التعديلات في القوانين اليابانية مؤخراً تقوم العديد من القرى بالاندماج لتشكل قرى أكبر أو بلدات أو مدن.
محافظات يابانية ليس فيها قرى
إهيمه وذلك بعد الاندماجات التي كان آخرها في 16 يناير 2005.