فيروسات عشية

اضغط هنا للاطلاع على كيفية قراءة التصنيف
اضغط هنا للاطلاع على كيفية قراءة التصنيف

فيروسات عشية

 
المرتبة التصنيفية رتبة[1][2]  تعديل قيمة خاصية (P105) في ويكي بيانات
التصنيف العلمي  تعديل قيمة خاصية (P171) في ويكي بيانات
فوق النطاق  حيويات
مملكة  فيروس
realm  ريبوفيريا
مملكة  Orthornavirae
شعبة  Pisuviricota
طائفة  Pisoniviricetes
الاسم العلمي
Nidovirales[1][2]  تعديل قيمة خاصية (P225) في ويكي بيانات
تعديل مصدري - تعديل  طالع توثيق القالب


الفيروسات العشية (بالإنجليزية: Nidovirales)‏هي رتبة لفيروسات ذات عوائل حيوانية وبشرية (مثال: فيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية (ميرس كوف) أو فيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة  التنفسية الحادة الوخيمة (سارس كوف). وتشمل فصائل الفيروسات التاجية (Coronaviridae)،[8][9] والفيروسات الشريانية (Arteriviridae)،[10] والفيروسات الرونية (Roniviridae)، والفيروسات العشية المتوسطة (Mesoniviridae).

سُميت رتبة الفيروسات العُشّية بناء على كلمة  نيدوس (nidus) اللاتينية التي تعني العُش، إذ تنتج جميع فيروسات هذه الرتبة مجموعة متداخلة من الحمض الريبوزي الرسول مشتركة في النهاية الطرفية 3’ في أثناء العدوى.[11]

علم الفيروسات

تتكون هذه المجموعة من فيروسات لديها مجموع مورثي من آر إن إيه مفرد السلسلة موجب الاتجاه. وباعتبار مجموعها الموروثي موجب الاتجاه، تستطيع الفيروسات استخدام بعض بروتينات الخلية المضيفة أثناء التضاعف والتعبير الجيني الذي يحدث في سيتوبلازم الخلية المضيفة.

تعبر هذه المجموعة من الفيروسات عن البروتينات البنيوية بشكل منفصل عن البروتينات غير البنيوية. فترمّز البروتينات البنيوية في منطقة 3 'من المجموع الموروثي ويُعبَّر عنها من خلال مجموعة من الحمض النووي الريبوزي الرسول تحت الجينومي. تشفِّر هذه الفيروسات ببتيداز أساسي واحد بين إنزيمَيّ الببتيداز الثانويين واحد وثلاثة اللذين يشاركان بشكل رئيس في التعبير عن جين بوليميراز الآر إن إيه المعتمدة على الآر إن إيه. هذه المجموعة من الببتيداز مسؤولة أيضًا عن تنشيط أو تعطيل بروتينات معينة في الوقت الصحيح في دورة حياة الفيروس، ما يضمن حدوث التضاعف في الوقت المناسب.

عُرف عدد كبير من البروتينات في المجموع الموروثي للفيروسات العُشّية، لكن وظيفتها لم تُحدد بعد. تشتمل الإنزيمات الأخرى التي قد تكون موجودة في المجموع الموروثي على إنزيمات الببتيداز المشابهة للباباين، وأنشطة إنزيمات الفسفاتاز في ربط أدينوزين ثنائي الفوسفات الريبوزي/ (أدينوزين ثنائي الفوسفات الريبوزي) المتعدد و/ أو أدينوزين ثنائي الفوسفات الريبوزي أحادي الفوسفات1''، وإنزيم فسفودايستراز النوكليوتيد الحلقي.

يحتوي معظم (لا كل) الحمض الريبوزي الرسول تحت الجيني الخاص بالفيروسات العشّية على تسلسل المنطقة 5′ غير المترجم المشتق من الطرف 5′ من الحمض النووي الريبوزي الجينومي.

يحدث انزياح الإطار الذي يولد انزياح الإطار ORF1b عند التسلسل المزلق سباعي النوكليوتيد (يوراسيل يوراسيل  يوراسيل أدينين أدينين أدينين سيستئين) UUUAAAC الواقع عكس اتجاه كودون توقف ORF1a وبنية العقدة الكاذبة المفترضة للحمض النووي الريبوزي.

لدى فيروس التهاب الكبد في الفئران (إم إتش في) أكبر مجموع موروثي من الحمض النووي الريبوزي غير المقسم إلى مقاطع، ويبلغ طوله 31.5 ألف زوج من القواعد، ويعَد هذا الفيروس من رتبة الفيروسات العُشّية.

التصنيف

يمكن تمييز رتبة الفيروسات هذه عن فيروسات الحمض النووي الريبوزي الأخرى بمجموعة من سبعة نطاقات محفوظة ــــ(5' تي إم 2)- (3 سي إل برو)-(تي إم 3)- (إتش إي إل 1)- (زد إم)- (إتش إي إل 1)- (نيندو يو-3')— مع ترميز الثلاثة الأولى في (أو آر إف 1 إيه) والأربعة الباقين في (أو آر إف 1 بي). (تي إم 2) و(تي إم 3) هما نطاقان عبر الغشاء، (آر دي آر بّي) هو بوليميراز الحمض النووي الريبوزي، (زد إم) هو نطاق ربط ذا زنك عنقودي منصهر بالهيليكاز (إتش إي إل 1)، (3 سي إل برو) عبارة عن ببتيداز يشبه السيستئين 3، و(نيندو يو-3') هو نوكلياز داخلي خاص باليورديلات. يحتوي (3 سي إل برو) على حفّاز ثنائي الهيستين-السيستئين، وهو أيضًا البروتين الرئيس لفيروس كورونا المرتبط بالمتلازمة  التنفسية الحادة الوخيمة.

يمكن تقسيم الفيروسات العُشّية  إلى فرعين حسب حجم المجموع الموروثي: تلك التي لديها مجموعات موروثة كبيرة (26.3-31.7 ألف زوج من القواعد) وتضمنت الفيروسات التاجية والفيروسات الرونية (الفيروسات العُشّية الكبيرة)، وتلك التي لديها مجموعات موروثة صغيرة (الفيروسات العُشّية الصغيرة) وتضمنت الفيروسات الشريانية ذات الصلة البعيدة (12.7-15.7 ألف زوج من القواعد). ترمّز الفيروسات العُشّية الكبيرة كلًّا من إنزيميّ '2 -أكسي- ناقل الميثي وإكسوريبونوكلياز (إكسو إن). هذا الأخير غير معتاد أبدًا في فيروس حمض نووي ريبوزي. ترمِّز الفيروسات العُشيّة الهيليكاز من الفصيلة 1، والنوكلياز الداخلي الخاص باليوريديلات (وهو إنزيم تنفرد به الفيروسات العُشّية)، والعديد من إنزيمات البروتياز.

ملاحظات

تنتمي الفيروسات العُشيّة إلى المجموعة الرابعة من نظام تصنيف بالتيمور.

عُزل فيروس ينتمي إلى هذه المجموعة -فيروس كفالي- من البعوض. لكن يبدو أنه غير مرتبط بالفيروسات الأخرى في هذه الرتبة، وربما يكون العضو الأول في عائلة جديدة.

عُزِل فيروس آخر من البعوض -فيروس نام دينه- يبدو أنه ينتمي لعائلة جديدة  في هذا الرتبة.[12]

عُرِف فيروس كفالي وفيروس نام دينه كنمطين مصليين من نفس النوع، ألفا ميزوفيروس -1 (Alphamesonivirus 1)، ووضِعا في العائلة المكتشفة حديثًا، الفيروسات العشية المتوسطة (Mesoniviridae)[13]

يعَد الفيروس المرتبط بالخياشيم (Gill-associated virus) وفيروس الرأس الأصفر (yellow head virus) أعضاء في هذا الرتبة وكلاهما معزول من القريدس. صُنِّف هذان الفيروسان الأخيران في عائلة الفيروسات الرونية (Roniviridae) جنس الفيروسات الرونية (Okavirus).[14][15]

قد ينتمي فيروس آخر، وهو فيروس وايت بريم (البراميس الأبيض)، المعزول من الأسماك إلى هذه الرتبة.[16]

مراجع

  1. ^ ا ب ج International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (30 Jun 2014), ICTV Master Species List 2013 v2 (بالإنجليزية), QID:Q18810383
  2. ^ ا ب ج International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (12 Jun 2015), ICTV Master Species List 2014 v4 (بالإنجليزية), QID:Q24716610
  3. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (26 May 2016), ICTV Master Species List 2015 v1 (بالإنجليزية), QID:Q24571893
  4. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (25 May 2017), ICTV Master Species List 2016 v1.3 (بالإنجليزية), QID:Q29000566
  5. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (17 Oct 2018), ICTV Master Species List 2018a v1 (بالإنجليزية), QID:Q57700017
  6. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (8 Mar 2019), ICTV Master Species List 2018b.v2 (بالإنجليزية), QID:Q62075759
  7. ^ International Committee on Taxonomy of Viruses, ed. (13 Mar 2018), ICTV Master Species List 2017 v1 (بالإنجليزية), QID:Q51526638
  8. ^ Luis Enjuanes, Isabel Sola, Sonia Zúñiga and Fernando Almazán (2008). "Coronavirus Replication and Interaction with Host". Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN:978-1-904455-22-6. {{استشهاد بكتاب}}: الوسيط غير المعروف |المحررين= تم تجاهله (مساعدة)
  9. ^ Volker Thiel، المحرر (2007). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology. Caister Academic Press. ISBN:978-1-904455-16-5.
  10. ^ Udeni B. R. Balasuriya and Eric J. Snijder (2008). "Arteriviruses". في Thomas C. Mettenleiter and Francisco Sobrino (المحرر). Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN:978-1-904455-22-6.
  11. ^ Antoine A.F. de Vries, Marian C. Horzinek, Peter J. M. Rottier, Raoul J. de Groot (1997). "The Genome Organization of the Nidovirales: Similarities and Differences between Arteri-, Toro-, and Coronaviruses". Seminars in Virology. ج. 8 ع. 1: 33–47. CiteSeerX:10.1.1.462.1825. DOI:10.1006/smvy.1997.0104.
  12. ^ Zirkel، F.؛ وآخرون (2011). "An Insect Nidovirus Emerging from a Primary Tropical Rainforest". mBio. ج. 2 ع. 3: e00077–11. DOI:10.1128/mBio.00077-11. PMC:3111606. PMID:21673192.
  13. ^ Nga، Phan Thi؛ وآخرون (2011). "Discovery of the First Insect Nidovirus, a Missing Evolutionary Link in the Emergence of the Largest RNA Virus Genomes". PLoS Pathogens. ج. 7 ع. 9: e1002215. DOI:10.1371/journal.ppat.1002215. PMC:3169540. PMID:21931546.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  14. ^ Zirkel، F؛ وآخرون (2013). "Identification and characterization of genetically divergent members of the newly established family Mesoniviridae". Journal of Virology. ج. 87 ع. 11: 6346–58. DOI:10.1128/JVI.00416-13. PMC:3648093. PMID:23536661.
  15. ^ Cowley، JA؛ Dimmock، CM؛ Spann، KM؛ Walker، PJ (2000). "Gill-associated virus of Penaeus monodon prawns: an invertebrate virus with ORF1a and ORF1b genes related to arteri- and coronaviruses". The Journal of General Virology. ج. 81 ع. Pt 6: 1473–84. DOI:10.1099/0022-1317-81-6-1473. PMID:10811931.
  16. ^ Schutze، H.؛ وآخرون (2006). "Characterization of White Bream Virus Reveals a Novel Genetic Cluster of Nidoviruses". Journal of Virology. ج. 80 ع. 23: 11598–11609. DOI:10.1128/JVI.01758-06. PMC:1642614. PMID:16987966.