تبدأ اللعبة عن ماريو وهو يعمل بمهنة طبيب وهو يرمي الأدوية على الفيروسات الشريرة، وكما يجب أن تكون كل الألوان مشابهة لأنواع الفيروس، فمثلا اللون الأزرق يقضي على فيروس له لون أزرق، والكبسولة باللون الأحمر تقضي على الفيروس بجسده اللون الأحمر، وهكذا، وفي كل فوز بالمرحلة، تزيد صعوبة مستويات اللعبة.
