Universitas Musamus awalnya berdiri dengan nama Sekolah Tinggi Teknologi Merauke (STTM), yang didirikan oleh Yayasan Pendidikan Anim Ha Merauke berdasarkan Akta Notaris Nomor 12 tahun 2001 tanggal 26 Januari 2001. STTM resmi didirikan dengan Keputusan Mendiknas RI Nomor 187/D/O/2001 tanggal 26 September 2001, dengan program studi Diploma Tiga (D-3) di bidang Teknik Sipil, Teknik Mesin, Teknik Elektro, dan Teknik Informatika13.
Pada Oktober 2005, tim kecil dibentuk untuk menyusun proposal perubahan status dari Sekolah Tinggi menjadi universitas. Kemudian pada 16 Agustus 2006, Mendiknas RI mengeluarkan izin operasional sekaligus mengubah status STTM menjadi Universitas Musamus Merauke (UNIMMER) berdasarkan SK Nomor 160/D/O/200613.
Selanjutnya, pada 12 Desember 2007, proposal perubahan status menjadi universitas negeri diserahkan ke Departemen Pendidikan Nasional. Setelah proses kajian dan visitasi oleh Tim Penegerian Ditjen Dikti pada awal 2009, pada 23 Mei 2009 dilakukan serah terima aset dan sumber daya manusia dari Pemerintah Daerah Kabupaten Merauke dan Yayasan Pendidikan Anim Ha kepada Departemen Pendidikan Nasional sebagai persiapan penegerian3.
Puncaknya, pada 22 November 2010, Universitas Musamus secara resmi diresmikan sebagai Perguruan Tinggi Negeri oleh Presiden Republik Indonesia, Dr. H. Susilo Bambang Yudhoyono, di Auditorium Universitas Cenderawasih Jayapura, ditandai dengan penandatanganan prasasti.
Sejak itu, Universitas Musamus berperan sebagai perguruan tinggi negeri di Merauke, Papua Selatan, dengan visi menghasilkan lulusan yang berkarakter, kompeten, dan berjiwa kewirausahaan serta mendukung pengembangan sumber daya manusia di wilayah tersebut.[1]
Universitas Musamus Merauke (Unmus) adalah Perguruan Tinggi Negeri di Kota Merauke, Provinsi Papua Selatan, yang berdiri pada tanggal 22 November 2010.[3] Universitas ini merupakan peralihan status dari Sekolah Tinggi Teknik (STT) Merauke menjadi Universitas Musamus Merauke. Rektor Unmus saat ini adalah Prof. Dr. Beatus Tambaip, M.A.[4]
