Stasiun Ugo-Honjō dilayani oleh Jalur Utama Uetsu, dan berjarak 2.289 kilometer (1.422 mi) dari terminus jalur tersebut di Stasiun Niitsu. Stasiun tersebut juga merupakan stasiun terminal untuk Jalur Chōkai Sanroku dan berjarak 23.0 kilometer dari terminus berlawanan dari jalur tersebut di Stasiun Yashima.