Bangunan Halte Museum Sejarah Jakarta berbentuk kecil dan dapat melayani bus hingga 2 dermaga untuk naik turun penumpang di sisi selatan serta 1 dermaga di sisi utara. Hal yang menjadikan halte ini unik yaitu halte ini juga merupakan salah satu dari dua halte Transjakarta yang bergaya Art Deco selain Halte Kali Besar yang juga terletak pada Koridor 1 dan Koridor 12 Transjakarta.
Berikut merupakan peta tata letak layanan rute koridor/BRT di Halte Museum Sejarah Jakarta 23 September 2024:
Jl. Kunir →
Timur
← Jl. Kunir
Peron pulau, pintu peron terbuka di sisi kiri arah perjalanan