Pada 7 Desember1880, ia terpilih menjabat Presiden Konfederasi Swiss untuk tahun 1881. Segera setelah kampanye pemilu kotor terhadap dirinya tersiar di pers, khususnya tentang kebiasaan makan berlebihan (obesitas) dan juga rumor bahwa dia adalah seorang pengunjung tetap di rumah bordil gay. Akibat kelelahan fisik dan depresi berat, Anderwert memilih mengakhiri hidup (bunuh diri) pada Hari Natal 1880 di "Kleine Schanze", sebuah taman kecil di samping Gedung Parlemen. Sepenggal kalimat surat perpisahan yang sempat terekspos berbunyi, "They want a victim, they shall have it" (Mereka ingin korban, mereka akan memilikinya).