Rute Transjakarta secara garis besar terbagi menjadi rute BRT (Bus Rapid Transit) dan Non-BRT. Rute Non-BRT dibagi dalam dua jenis: Non-BRT Integrasi (terintegrasi BRT dengan berhenti di sebagian halte BRT dan sebagian bus stop trotoar) dan Non-BRT Non-Integrasi (tidak terintegrasi BRT dan hanya berhenti di bus stop trotoar). Terdapat 14 dari 19 koridor utama yang saat ini beroperasi. Koridor pertama dibuka pada tahun 2004, yakni Blok M — Kota. Sebagian besar rute memiliki lajur tersendiri, yang terpisah dengan lajur kendaraan pribadi.
Puri Beta 2 — Tegal Mampang
Blok M BCA
CSW 1 (melalui jembatan penyeberangan)
Galunggung (melalui jembatan penyeberangan)
Dukuh Atas BNI
BNI City
Dukuh Atas
221
220
1222
1205
1206
Kota (dalam pembangunan)
401
Terminal Bus Pulo Gadung
Pulomas
Simpang Cempaka (melalui jembatan penyeberangan)
1401
Senen Sentral (melalui jembatan penyeberangan)
Pasar Senen
Terminal Bus Senen
1402
Gambir 2 (transit di luar area berbayar)
315
314
115
Gambir (transit di luar area berbayar)
114
817
818
Grogol Reformasi (melalui jembatan penyeberangan)
Terminal Bus Grogol
201
Terminal Bus Rawamangun
Pemuda Pramuka (melalui jembatan penyeberangan)
Matraman (melalui jembatan penyeberangan)
Manggarai (dalam pembangunan)
Terminal Bus Manggarai
619
620
Dukuh Atas (melalui jembatan penyeberangan)
Dukuh Atas (direncanakan)
Dermaga Ancol
1209
1210
Pasar Senen (melalui jembatan penyeberangan)
Flyover Pramuka (melalui jembatan penyeberangan)
Stasiun Jatinegara (melalui jembatan penyeberangan)
1115
714
1116
Simpang Kuningan (melalui jembatan penyeberangan)
416
417
Kampung Rambutan
Kampung Rambutan (direncanakan)
Raya Bogor (direncanakan)
PGC (transit di luar area berbayar)
1021
903
1020
904
518
Terminal Bus Lebak Bulus
309
310
920
Grogol (melalui jembatan penyeberangan)
919
709
710
Cikoko
Underpass Kuningan (melalui jembatan penyeberangan)
Bendungan Hilir (melalui jembatan penyeberangan)*)
820
819
1225
1201
Terminal Bus Tanjung Priok
1221
1220
1219
1218
1217
Cempaka Mas (melalui jembatan penyeberangan)
Simpang Pramuka (melalui jembatan penyeberangan)
1113
708
Cililitan (transit di luar area berbayar)
1015
517
926
Tidak dilayani layanan AMARI rute M12
122
120
925
121
503
504
1405
1406
1407
Beberapa bus AMARI arah Sunter Kelapa Gading (→) berhenti di sini dan mewajibkan penumpang turun
1006
1005
1004
1003
1002
1001
Tidak beroperasi sementara saat ini
Selama penyesuaian sementara, arah CBD Ciledug (←) berterminus di Puri Beta 2. Arah Tegal Mampang (→) dari Puri Beta 2 langsung menuju Puri Beta 1
Kebayoran (melalui jembatan penyeberangan)
Kejaksaan Agung (melalui jembatan penyeberangan)
ASEAN (melalui jembatan penyeberangan)
1213
1212
1211
212
Commuter Line dan layanan kereta api antarkota di Stasiun Pasar Senen
(Koridor 5 di halte Senen Sentral)
213
Grogol Reformasi (via skybridge)
Harmoni
Lokasi Pengunjung: 3.15.141.61