Anti-CRISPR

Anti-CRISPR (protein AcrIIA4)
Struktur AcrIIA4 diperoleh dari PDB dengan penampil JSmol.
Identifiers
OrganismeProfag Listeria monocytogenes
SimbolAcrIIA4
PDB5XN4
UniProtA0A247D711

Anti-CRISPR (bahasa Inggris: Anti-Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats atau Acr) adalah sekelompok protein yang ditemukan dalam bakteriofag (kadang hanya disebut fag), yang menghambat aktivitas normal CRISPR-Cas, sistem kekebalan bakteri tertentu.[1] CRISPR terdiri dari urutan genom yang dapat ditemukan pada organisme prokariotik, yang berasal dari bakteriofag yang menginfeksi bakteri tersbut sebelumnya, dan digunakan untuk mempertahankan sel dari serangan virus lebih lanjut.[2] Anti-CRISPR merupakan hasil dari proses evolusi terjadi dalam bakteriofag untuk mencegah genomnya dihancurkan oleh sel prokariotik yang akan mereka infeksi.[3]

Sebelum ditemukannya protein Anti-CRISPR, mutasi merupakan satu-satunya cara yang diketahui oleh peneliti untuk menjelaskan bahwa bakteriofag dapat menghindari pemotongan yang dimediasi oleh CRISPR-Cas, yaitu dengan mengurangi afinitas pengikatan fag dan CRISPR. Meskipun demikian, bakteri memiliki mekanisme untuk menargetkan kembali bakteriofag mutan, melalui suatu proses yang disebut "priming adaptation". Sejauh yang diketahui para peneliti, anti-CRISPR merupakan cara paling efektif untuk memastikan kelangsungan hidup bakteriofag sepanjang proses infeksi bakteri.[4]

Referensi

  1. ^ Nakamura M, Srinivasan P, Chavez M, Carter MA, Dominguez AA, La Russa M, et al. (January 2019). "Anti-CRISPR-mediated control of gene editing and synthetic circuits in eukaryotic cells". Nature Communications. 10 (1): 194. Bibcode:2019NatCo..10..194N. doi:10.1038/s41467-018-08158-x. PMC 6331597 alt=Dapat diakses gratis. PMID 30643127. 
  2. ^ Barrangou R (February 2015). "The roles of CRISPR-Cas systems in adaptive immunity and beyond". Current Opinion in Immunology. 32: 36–41. doi:10.1016/j.coi.2014.12.008. PMID 25574773. 
  3. ^ Stanley SY, Borges AL, Chen KH, Swaney DL, Krogan NJ, Bondy-Denomy J, Davidson AR (September 2019). "Anti-CRISPR-Associated Proteins Are Crucial Repressors of Anti-CRISPR Transcription". Cell. 178 (6): 1452–1464.e13. doi:10.1016/j.cell.2019.07.046. PMC 6754177 alt=Dapat diakses gratis. PMID 31474367. 
  4. ^ Maxwell KL (October 2017). "The Anti-CRISPR Story: A Battle for Survival". Molecular Cell. 68 (1): 8–14. doi:10.1016/j.molcel.2017.09.002. PMID 28985512.